Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ7

Rcbtb2, RCC1 and BTB domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb2Q99LJ7 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rcbtb2Q99LJ7 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rcbtb2Q99LJ7 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Rcbtb2Q99LJ7 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Rcbtb2Q99LJ7 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rcbtb2Q99LJ7 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rcbtb2Q99LJ7 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Rcbtb2Q99LJ7 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Rcbtb2Q99LJ7 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rcbtb2Q99LJ7 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rcbtb2Q99LJ7 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rcbtb2Q99LJ7 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rcbtb2Q99LJ7 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rcbtb2Q99LJ7 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rcbtb2Q99LJ7 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rcbtb2Q99LJ7 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rcbtb2Q99LJ7 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rcbtb2Q99LJ7 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rcbtb2Q99LJ7 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rcbtb2Q99LJ7 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rcbtb2Q99LJ7 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rcbtb2Q99LJ7 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rcbtb2Q99LJ7 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rcbtb2Q99LJ7 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rcbtb2Q99LJ7 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rcbtb2Q99LJ7 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rcbtb2Q99LJ7 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rcbtb2Q99LJ7 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rcbtb2Q99LJ7 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rcbtb2Q99LJ7 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rcbtb2Q99LJ7 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rcbtb2Q99LJ7 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rcbtb2Q99LJ7 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rcbtb2Q99LJ7 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rcbtb2Q99LJ7 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rcbtb2Q99LJ7 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rcbtb2Q99LJ7 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rcbtb2Q99LJ7 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rcbtb2Q99LJ7 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rcbtb2Q99LJ7 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rcbtb2Q99LJ7 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rcbtb2Q99LJ7 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rcbtb2Q99LJ7 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rcbtb2Q99LJ7 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Rcbtb2Q99LJ7 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rcbtb2Q99LJ7 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rcbtb2Q99LJ7 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rcbtb2Q99LJ7 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Rcbtb2Q99LJ7 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rcbtb2Q99LJ7 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rcbtb2Q99LJ7 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Rcbtb2Q99LJ7 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rcbtb2Q99LJ7 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rcbtb2Q99LJ7 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Rcbtb2Q99LJ7 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Rcbtb2Q99LJ7 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rcbtb2Q99LJ7 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rcbtb2Q99LJ7 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rcbtb2Q99LJ7 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rcbtb2Q99LJ7 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rcbtb2Q99LJ7 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rcbtb2Q99LJ7 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rcbtb2Q99LJ7 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rcbtb2Q99LJ7 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rcbtb2Q99LJ7 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rcbtb2Q99LJ7 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rcbtb2Q99LJ7 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rcbtb2Q99LJ7 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rcbtb2Q99LJ7 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rcbtb2Q99LJ7 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rcbtb2Q99LJ7 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rcbtb2Q99LJ7 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Rcbtb2Q99LJ7 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rcbtb2Q99LJ7 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rcbtb2Q99LJ7 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rcbtb2Q99LJ7 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rcbtb2Q99LJ7 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rcbtb2Q99LJ7 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rcbtb2Q99LJ7 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rcbtb2Q99LJ7 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rcbtb2Q99LJ7 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rcbtb2Q99LJ7 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rcbtb2Q99LJ7 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rcbtb2Q99LJ7 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms