Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI9

Clp1, Polyribonucleotide 5'-hydroxyl-kinase Clp1, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clp1Q99LI9 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Clp1Q99LI9 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clp1Q99LI9 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clp1Q99LI9 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clp1Q99LI9 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clp1Q99LI9 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clp1Q99LI9 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clp1Q99LI9 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clp1Q99LI9 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clp1Q99LI9 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clp1Q99LI9 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clp1Q99LI9 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clp1Q99LI9 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clp1Q99LI9 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clp1Q99LI9 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clp1Q99LI9 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clp1Q99LI9 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clp1Q99LI9 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clp1Q99LI9 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clp1Q99LI9 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clp1Q99LI9 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clp1Q99LI9 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clp1Q99LI9 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clp1Q99LI9 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clp1Q99LI9 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clp1Q99LI9 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clp1Q99LI9 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clp1Q99LI9 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clp1Q99LI9 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clp1Q99LI9 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Clp1Q99LI9 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Clp1Q99LI9 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clp1Q99LI9 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clp1Q99LI9 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Clp1Q99LI9 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clp1Q99LI9 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Clp1Q99LI9 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clp1Q99LI9 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Clp1Q99LI9 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clp1Q99LI9 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clp1Q99LI9 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clp1Q99LI9 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clp1Q99LI9 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clp1Q99LI9 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clp1Q99LI9 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clp1Q99LI9 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clp1Q99LI9 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clp1Q99LI9 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clp1Q99LI9 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clp1Q99LI9 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clp1Q99LI9 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clp1Q99LI9 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clp1Q99LI9 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clp1Q99LI9 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clp1Q99LI9 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clp1Q99LI9 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clp1Q99LI9 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clp1Q99LI9 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clp1Q99LI9 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clp1Q99LI9 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Clp1Q99LI9 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Clp1Q99LI9 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Clp1Q99LI9 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clp1Q99LI9 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clp1Q99LI9 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Clp1Q99LI9 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Clp1Q99LI9 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clp1Q99LI9 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clp1Q99LI9 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clp1Q99LI9 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clp1Q99LI9 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clp1Q99LI9 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clp1Q99LI9 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clp1Q99LI9 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clp1Q99LI9 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clp1Q99LI9 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clp1Q99LI9 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clp1Q99LI9 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Clp1Q99LI9 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clp1Q99LI9 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clp1Q99LI9 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clp1Q99LI9 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clp1Q99LI9 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clp1Q99LI9 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clp1Q99LI9 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clp1Q99LI9 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clp1Q99LI9 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clp1Q99LI9 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clp1Q99LI9 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clp1Q99LI9 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Clp1Q99LI9 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clp1Q99LI9 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clp1Q99LI9 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Clp1Q99LI9 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clp1Q99LI9 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clp1Q99LI9 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clp1Q99LI9 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clp1Q99LI9 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clp1Q99LI9 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clp1Q99LI9 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms