Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG2

Tnpo2, Transportin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnpo2Q99LG2 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tnpo2Q99LG2 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tnpo2Q99LG2 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnpo2Q99LG2 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnpo2Q99LG2 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnpo2Q99LG2 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnpo2Q99LG2 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnpo2Q99LG2 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnpo2Q99LG2 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnpo2Q99LG2 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnpo2Q99LG2 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnpo2Q99LG2 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnpo2Q99LG2 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnpo2Q99LG2 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnpo2Q99LG2 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnpo2Q99LG2 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnpo2Q99LG2 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnpo2Q99LG2 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnpo2Q99LG2 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnpo2Q99LG2 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnpo2Q99LG2 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnpo2Q99LG2 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnpo2Q99LG2 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnpo2Q99LG2 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnpo2Q99LG2 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnpo2Q99LG2 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnpo2Q99LG2 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnpo2Q99LG2 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnpo2Q99LG2 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnpo2Q99LG2 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnpo2Q99LG2 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnpo2Q99LG2 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnpo2Q99LG2 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnpo2Q99LG2 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnpo2Q99LG2 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnpo2Q99LG2 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnpo2Q99LG2 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnpo2Q99LG2 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnpo2Q99LG2 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnpo2Q99LG2 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnpo2Q99LG2 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnpo2Q99LG2 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnpo2Q99LG2 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnpo2Q99LG2 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnpo2Q99LG2 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnpo2Q99LG2 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnpo2Q99LG2 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnpo2Q99LG2 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnpo2Q99LG2 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnpo2Q99LG2 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnpo2Q99LG2 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnpo2Q99LG2 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnpo2Q99LG2 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnpo2Q99LG2 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnpo2Q99LG2 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnpo2Q99LG2 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnpo2Q99LG2 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnpo2Q99LG2 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnpo2Q99LG2 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnpo2Q99LG2 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnpo2Q99LG2 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnpo2Q99LG2 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnpo2Q99LG2 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnpo2Q99LG2 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnpo2Q99LG2 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnpo2Q99LG2 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnpo2Q99LG2 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnpo2Q99LG2 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnpo2Q99LG2 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnpo2Q99LG2 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnpo2Q99LG2 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnpo2Q99LG2 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnpo2Q99LG2 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnpo2Q99LG2 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnpo2Q99LG2 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnpo2Q99LG2 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnpo2Q99LG2 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnpo2Q99LG2 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnpo2Q99LG2 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnpo2Q99LG2 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnpo2Q99LG2 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnpo2Q99LG2 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnpo2Q99LG2 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnpo2Q99LG2 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnpo2Q99LG2 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnpo2Q99LG2 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnpo2Q99LG2 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnpo2Q99LG2 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnpo2Q99LG2 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnpo2Q99LG2 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnpo2Q99LG2 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnpo2Q99LG2 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnpo2Q99LG2 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnpo2Q99LG2 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnpo2Q99LG2 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnpo2Q99LG2 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnpo2Q99LG2 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnpo2Q99LG2 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnpo2Q99LG2 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnpo2Q99LG2 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms