Protein–RNA interactions for Protein: Q99KC8

Vwa5a, von Willebrand factor A domain-containing protein 5A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwa5aQ99KC8 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vwa5aQ99KC8 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vwa5aQ99KC8 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vwa5aQ99KC8 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vwa5aQ99KC8 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Vwa5aQ99KC8 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vwa5aQ99KC8 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vwa5aQ99KC8 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vwa5aQ99KC8 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vwa5aQ99KC8 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vwa5aQ99KC8 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vwa5aQ99KC8 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vwa5aQ99KC8 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vwa5aQ99KC8 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vwa5aQ99KC8 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vwa5aQ99KC8 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vwa5aQ99KC8 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vwa5aQ99KC8 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vwa5aQ99KC8 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Vwa5aQ99KC8 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vwa5aQ99KC8 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vwa5aQ99KC8 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vwa5aQ99KC8 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vwa5aQ99KC8 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vwa5aQ99KC8 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vwa5aQ99KC8 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vwa5aQ99KC8 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vwa5aQ99KC8 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vwa5aQ99KC8 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vwa5aQ99KC8 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vwa5aQ99KC8 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vwa5aQ99KC8 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Vwa5aQ99KC8 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vwa5aQ99KC8 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vwa5aQ99KC8 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vwa5aQ99KC8 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vwa5aQ99KC8 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Vwa5aQ99KC8 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Vwa5aQ99KC8 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vwa5aQ99KC8 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Vwa5aQ99KC8 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vwa5aQ99KC8 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vwa5aQ99KC8 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vwa5aQ99KC8 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vwa5aQ99KC8 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vwa5aQ99KC8 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vwa5aQ99KC8 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Vwa5aQ99KC8 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vwa5aQ99KC8 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vwa5aQ99KC8 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vwa5aQ99KC8 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Vwa5aQ99KC8 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vwa5aQ99KC8 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vwa5aQ99KC8 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vwa5aQ99KC8 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vwa5aQ99KC8 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vwa5aQ99KC8 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vwa5aQ99KC8 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vwa5aQ99KC8 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Vwa5aQ99KC8 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vwa5aQ99KC8 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Vwa5aQ99KC8 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vwa5aQ99KC8 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vwa5aQ99KC8 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vwa5aQ99KC8 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vwa5aQ99KC8 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vwa5aQ99KC8 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vwa5aQ99KC8 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vwa5aQ99KC8 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vwa5aQ99KC8 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vwa5aQ99KC8 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vwa5aQ99KC8 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vwa5aQ99KC8 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vwa5aQ99KC8 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vwa5aQ99KC8 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vwa5aQ99KC8 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vwa5aQ99KC8 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vwa5aQ99KC8 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vwa5aQ99KC8 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vwa5aQ99KC8 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vwa5aQ99KC8 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vwa5aQ99KC8 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vwa5aQ99KC8 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vwa5aQ99KC8 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vwa5aQ99KC8 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vwa5aQ99KC8 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vwa5aQ99KC8 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vwa5aQ99KC8 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vwa5aQ99KC8 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vwa5aQ99KC8 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Vwa5aQ99KC8 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Vwa5aQ99KC8 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Vwa5aQ99KC8 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vwa5aQ99KC8 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vwa5aQ99KC8 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vwa5aQ99KC8 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vwa5aQ99KC8 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vwa5aQ99KC8 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vwa5aQ99KC8 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vwa5aQ99KC8 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms