Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ddb2Q99J79 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ddb2Q99J79 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ddb2Q99J79 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ddb2Q99J79 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ddb2Q99J79 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ddb2Q99J79 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Ddb2Q99J79 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Ddb2Q99J79 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ddb2Q99J79 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Ddb2Q99J79 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ddb2Q99J79 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Ddb2Q99J79 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Ddb2Q99J79 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Ddb2Q99J79 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Ddb2Q99J79 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ddb2Q99J79 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
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Ddb2Q99J79 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ddb2Q99J79 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ddb2Q99J79 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ddb2Q99J79 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ddb2Q99J79 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ddb2Q99J79 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ddb2Q99J79 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ddb2Q99J79 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ddb2Q99J79 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ddb2Q99J79 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ddb2Q99J79 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ddb2Q99J79 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ddb2Q99J79 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ddb2Q99J79 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
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Ddb2Q99J79 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ddb2Q99J79 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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