Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Rnf144aQ925F3 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rnf144aQ925F3 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rnf144aQ925F3 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rnf144aQ925F3 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rnf144aQ925F3 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rnf144aQ925F3 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rnf144aQ925F3 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Rnf144aQ925F3 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rnf144aQ925F3 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rnf144aQ925F3 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rnf144aQ925F3 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rnf144aQ925F3 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rnf144aQ925F3 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rnf144aQ925F3 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rnf144aQ925F3 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rnf144aQ925F3 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rnf144aQ925F3 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rnf144aQ925F3 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Rnf144aQ925F3 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
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