Protein–RNA interactions for Protein: Q920D3

Med28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med28Q920D3 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms