Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp3Q91W36 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Usp3Q91W36 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Usp3Q91W36 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp3Q91W36 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp3Q91W36 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Usp3Q91W36 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Usp3Q91W36 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Usp3Q91W36 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp3Q91W36 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp3Q91W36 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp3Q91W36 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp3Q91W36 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Usp3Q91W36 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp3Q91W36 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp3Q91W36 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp3Q91W36 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp3Q91W36 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp3Q91W36 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp3Q91W36 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp3Q91W36 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp3Q91W36 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp3Q91W36 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Usp3Q91W36 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp3Q91W36 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Usp3Q91W36 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp3Q91W36 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp3Q91W36 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp3Q91W36 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Usp3Q91W36 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Usp3Q91W36 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp3Q91W36 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp3Q91W36 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Usp3Q91W36 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp3Q91W36 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Usp3Q91W36 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Usp3Q91W36 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp3Q91W36 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Usp3Q91W36 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp3Q91W36 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp3Q91W36 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp3Q91W36 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Usp3Q91W36 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp3Q91W36 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp3Q91W36 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Usp3Q91W36 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp3Q91W36 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp3Q91W36 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp3Q91W36 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp3Q91W36 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp3Q91W36 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Usp3Q91W36 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Usp3Q91W36 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Usp3Q91W36 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp3Q91W36 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Usp3Q91W36 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Usp3Q91W36 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Usp3Q91W36 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Usp3Q91W36 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Usp3Q91W36 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Usp3Q91W36 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Usp3Q91W36 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Usp3Q91W36 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp3Q91W36 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp3Q91W36 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp3Q91W36 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Usp3Q91W36 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp3Q91W36 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Usp3Q91W36 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp3Q91W36 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Usp3Q91W36 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Usp3Q91W36 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp3Q91W36 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp3Q91W36 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Usp3Q91W36 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp3Q91W36 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp3Q91W36 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp3Q91W36 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Usp3Q91W36 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Usp3Q91W36 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Usp3Q91W36 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp3Q91W36 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp3Q91W36 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp3Q91W36 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp3Q91W36 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp3Q91W36 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp3Q91W36 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp3Q91W36 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp3Q91W36 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp3Q91W36 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp3Q91W36 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp3Q91W36 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Usp3Q91W36 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp3Q91W36 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp3Q91W36 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp3Q91W36 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp3Q91W36 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp3Q91W36 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp3Q91W36 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp3Q91W36 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms