Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

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Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxc12Q8K5B8 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxc12Q8K5B8 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxc12Q8K5B8 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxc12Q8K5B8 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxc12Q8K5B8 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxc12Q8K5B8 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxc12Q8K5B8 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxc12Q8K5B8 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxc12Q8K5B8 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxc12Q8K5B8 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxc12Q8K5B8 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxc12Q8K5B8 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxc12Q8K5B8 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxc12Q8K5B8 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Hoxc12Q8K5B8 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxc12Q8K5B8 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxc12Q8K5B8 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxc12Q8K5B8 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxc12Q8K5B8 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxc12Q8K5B8 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxc12Q8K5B8 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxc12Q8K5B8 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Hoxc12Q8K5B8 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Hoxc12Q8K5B8 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxc12Q8K5B8 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxc12Q8K5B8 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxc12Q8K5B8 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxc12Q8K5B8 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Hoxc12Q8K5B8 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxc12Q8K5B8 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxc12Q8K5B8 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxc12Q8K5B8 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Hoxc12Q8K5B8 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxc12Q8K5B8 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxc12Q8K5B8 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxc12Q8K5B8 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxc12Q8K5B8 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxc12Q8K5B8 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxc12Q8K5B8 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxc12Q8K5B8 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxc12Q8K5B8 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxc12Q8K5B8 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Hoxc12Q8K5B8 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxc12Q8K5B8 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Hoxc12Q8K5B8 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxc12Q8K5B8 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxc12Q8K5B8 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxc12Q8K5B8 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxc12Q8K5B8 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxc12Q8K5B8 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxc12Q8K5B8 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxc12Q8K5B8 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxc12Q8K5B8 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxc12Q8K5B8 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxc12Q8K5B8 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxc12Q8K5B8 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxc12Q8K5B8 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxc12Q8K5B8 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxc12Q8K5B8 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxc12Q8K5B8 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxc12Q8K5B8 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxc12Q8K5B8 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxc12Q8K5B8 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxc12Q8K5B8 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxc12Q8K5B8 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxc12Q8K5B8 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxc12Q8K5B8 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxc12Q8K5B8 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxc12Q8K5B8 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxc12Q8K5B8 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxc12Q8K5B8 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
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