Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3N2

Vmn1r188, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r188Q8K3N2 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vmn1r188Q8K3N2 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vmn1r188Q8K3N2 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r188Q8K3N2 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r188Q8K3N2 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r188Q8K3N2 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r188Q8K3N2 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vmn1r188Q8K3N2 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms