Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I4

Myrip, Rab effector MyRIP, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyripQ8K3I4 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MyripQ8K3I4 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MyripQ8K3I4 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MyripQ8K3I4 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MyripQ8K3I4 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MyripQ8K3I4 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MyripQ8K3I4 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MyripQ8K3I4 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MyripQ8K3I4 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MyripQ8K3I4 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MyripQ8K3I4 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MyripQ8K3I4 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MyripQ8K3I4 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MyripQ8K3I4 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MyripQ8K3I4 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MyripQ8K3I4 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MyripQ8K3I4 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MyripQ8K3I4 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MyripQ8K3I4 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MyripQ8K3I4 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MyripQ8K3I4 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MyripQ8K3I4 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MyripQ8K3I4 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MyripQ8K3I4 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MyripQ8K3I4 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MyripQ8K3I4 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MyripQ8K3I4 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MyripQ8K3I4 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MyripQ8K3I4 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MyripQ8K3I4 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MyripQ8K3I4 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MyripQ8K3I4 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MyripQ8K3I4 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MyripQ8K3I4 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MyripQ8K3I4 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MyripQ8K3I4 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MyripQ8K3I4 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MyripQ8K3I4 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MyripQ8K3I4 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MyripQ8K3I4 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MyripQ8K3I4 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MyripQ8K3I4 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MyripQ8K3I4 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MyripQ8K3I4 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MyripQ8K3I4 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MyripQ8K3I4 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MyripQ8K3I4 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MyripQ8K3I4 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MyripQ8K3I4 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MyripQ8K3I4 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MyripQ8K3I4 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MyripQ8K3I4 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MyripQ8K3I4 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
MyripQ8K3I4 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MyripQ8K3I4 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MyripQ8K3I4 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MyripQ8K3I4 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MyripQ8K3I4 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MyripQ8K3I4 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MyripQ8K3I4 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MyripQ8K3I4 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MyripQ8K3I4 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MyripQ8K3I4 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MyripQ8K3I4 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MyripQ8K3I4 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MyripQ8K3I4 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MyripQ8K3I4 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MyripQ8K3I4 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
MyripQ8K3I4 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MyripQ8K3I4 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MyripQ8K3I4 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MyripQ8K3I4 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MyripQ8K3I4 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MyripQ8K3I4 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MyripQ8K3I4 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms