Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
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Trappc12Q8K2L8 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trappc12Q8K2L8 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trappc12Q8K2L8 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trappc12Q8K2L8 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trappc12Q8K2L8 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trappc12Q8K2L8 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trappc12Q8K2L8 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Trappc12Q8K2L8 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
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Trappc12Q8K2L8 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trappc12Q8K2L8 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trappc12Q8K2L8 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trappc12Q8K2L8 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trappc12Q8K2L8 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Trappc12Q8K2L8 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trappc12Q8K2L8 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trappc12Q8K2L8 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Trappc12Q8K2L8 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trappc12Q8K2L8 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trappc12Q8K2L8 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trappc12Q8K2L8 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trappc12Q8K2L8 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trappc12Q8K2L8 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trappc12Q8K2L8 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
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Trappc12Q8K2L8 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Trappc12Q8K2L8 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Trappc12Q8K2L8 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Trappc12Q8K2L8 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Trappc12Q8K2L8 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Trappc12Q8K2L8 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Trappc12Q8K2L8 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc12Q8K2L8 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Trappc12Q8K2L8 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc12Q8K2L8 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc12Q8K2L8 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc12Q8K2L8 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc12Q8K2L8 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc12Q8K2L8 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc12Q8K2L8 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc12Q8K2L8 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc12Q8K2L8 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc12Q8K2L8 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc12Q8K2L8 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc12Q8K2L8 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc12Q8K2L8 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc12Q8K2L8 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc12Q8K2L8 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc12Q8K2L8 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc12Q8K2L8 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc12Q8K2L8 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc12Q8K2L8 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc12Q8K2L8 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc12Q8K2L8 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc12Q8K2L8 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc12Q8K2L8 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc12Q8K2L8 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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