Protein–RNA interactions for Protein: Q8K045

Pkn3, Serine/threonine-protein kinase N3, mousemouse

Predictions only

Length 878 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn3Q8K045 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkn3Q8K045 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkn3Q8K045 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkn3Q8K045 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkn3Q8K045 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkn3Q8K045 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkn3Q8K045 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkn3Q8K045 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkn3Q8K045 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkn3Q8K045 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkn3Q8K045 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkn3Q8K045 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkn3Q8K045 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkn3Q8K045 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkn3Q8K045 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkn3Q8K045 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkn3Q8K045 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkn3Q8K045 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkn3Q8K045 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkn3Q8K045 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkn3Q8K045 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkn3Q8K045 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkn3Q8K045 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkn3Q8K045 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkn3Q8K045 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkn3Q8K045 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkn3Q8K045 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkn3Q8K045 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkn3Q8K045 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkn3Q8K045 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkn3Q8K045 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkn3Q8K045 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkn3Q8K045 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkn3Q8K045 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkn3Q8K045 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkn3Q8K045 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkn3Q8K045 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkn3Q8K045 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkn3Q8K045 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkn3Q8K045 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkn3Q8K045 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkn3Q8K045 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkn3Q8K045 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkn3Q8K045 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkn3Q8K045 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkn3Q8K045 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkn3Q8K045 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkn3Q8K045 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkn3Q8K045 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkn3Q8K045 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkn3Q8K045 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkn3Q8K045 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkn3Q8K045 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkn3Q8K045 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkn3Q8K045 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkn3Q8K045 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkn3Q8K045 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkn3Q8K045 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkn3Q8K045 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkn3Q8K045 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkn3Q8K045 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkn3Q8K045 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkn3Q8K045 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkn3Q8K045 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkn3Q8K045 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkn3Q8K045 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkn3Q8K045 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkn3Q8K045 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkn3Q8K045 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkn3Q8K045 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkn3Q8K045 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkn3Q8K045 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkn3Q8K045 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkn3Q8K045 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkn3Q8K045 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkn3Q8K045 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkn3Q8K045 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkn3Q8K045 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkn3Q8K045 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkn3Q8K045 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkn3Q8K045 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkn3Q8K045 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkn3Q8K045 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkn3Q8K045 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkn3Q8K045 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkn3Q8K045 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkn3Q8K045 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkn3Q8K045 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkn3Q8K045 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkn3Q8K045 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkn3Q8K045 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkn3Q8K045 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkn3Q8K045 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkn3Q8K045 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkn3Q8K045 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkn3Q8K045 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkn3Q8K045 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkn3Q8K045 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkn3Q8K045 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkn3Q8K045 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.6 ms