Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms