Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms