Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEJ8

Gm9955, Predicted gene 9955 (Fragment), mousemouse

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Length 102 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9955Q8CEJ8 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
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Gm9955Q8CEJ8 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
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Gm9955Q8CEJ8 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
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Gm9955Q8CEJ8 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
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Gm9955Q8CEJ8 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
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Gm9955Q8CEJ8 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
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Gm9955Q8CEJ8 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
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Gm9955Q8CEJ8 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
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Gm9955Q8CEJ8 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms