Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAS9

Parp9, Poly [ADP-ribose] polymerase 9, mousemouse

Predictions only

Length 866 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp9Q8CAS9 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Parp9Q8CAS9 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Parp9Q8CAS9 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Parp9Q8CAS9 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Parp9Q8CAS9 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Parp9Q8CAS9 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Parp9Q8CAS9 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Parp9Q8CAS9 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Parp9Q8CAS9 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Parp9Q8CAS9 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Parp9Q8CAS9 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Parp9Q8CAS9 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Parp9Q8CAS9 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Parp9Q8CAS9 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Parp9Q8CAS9 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Parp9Q8CAS9 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Parp9Q8CAS9 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Parp9Q8CAS9 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Parp9Q8CAS9 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Parp9Q8CAS9 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Parp9Q8CAS9 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Parp9Q8CAS9 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Parp9Q8CAS9 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Parp9Q8CAS9 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Parp9Q8CAS9 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Parp9Q8CAS9 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Parp9Q8CAS9 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Parp9Q8CAS9 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Parp9Q8CAS9 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Parp9Q8CAS9 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Parp9Q8CAS9 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Parp9Q8CAS9 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Parp9Q8CAS9 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Parp9Q8CAS9 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Parp9Q8CAS9 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Parp9Q8CAS9 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Parp9Q8CAS9 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Parp9Q8CAS9 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Parp9Q8CAS9 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Parp9Q8CAS9 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Parp9Q8CAS9 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Parp9Q8CAS9 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Parp9Q8CAS9 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Parp9Q8CAS9 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Parp9Q8CAS9 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Parp9Q8CAS9 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Parp9Q8CAS9 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Parp9Q8CAS9 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Parp9Q8CAS9 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Parp9Q8CAS9 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Parp9Q8CAS9 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Parp9Q8CAS9 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Parp9Q8CAS9 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Parp9Q8CAS9 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Parp9Q8CAS9 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Parp9Q8CAS9 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Parp9Q8CAS9 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Parp9Q8CAS9 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Parp9Q8CAS9 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Parp9Q8CAS9 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Parp9Q8CAS9 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Parp9Q8CAS9 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Parp9Q8CAS9 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Parp9Q8CAS9 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Parp9Q8CAS9 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Parp9Q8CAS9 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Parp9Q8CAS9 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Parp9Q8CAS9 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Parp9Q8CAS9 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Parp9Q8CAS9 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Parp9Q8CAS9 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Parp9Q8CAS9 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Parp9Q8CAS9 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Parp9Q8CAS9 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Parp9Q8CAS9 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Parp9Q8CAS9 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Parp9Q8CAS9 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Parp9Q8CAS9 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Parp9Q8CAS9 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Parp9Q8CAS9 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Parp9Q8CAS9 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Parp9Q8CAS9 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Parp9Q8CAS9 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Parp9Q8CAS9 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Parp9Q8CAS9 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Parp9Q8CAS9 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Parp9Q8CAS9 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Parp9Q8CAS9 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Parp9Q8CAS9 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Parp9Q8CAS9 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Parp9Q8CAS9 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Parp9Q8CAS9 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Parp9Q8CAS9 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Parp9Q8CAS9 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Parp9Q8CAS9 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Parp9Q8CAS9 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Parp9Q8CAS9 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Parp9Q8CAS9 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Parp9Q8CAS9 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Parp9Q8CAS9 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms