Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7N7

Aph1b, Gamma-secretase subunit APH-1B, mousemouse

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Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aph1bQ8C7N7 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Aph1bQ8C7N7 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Aph1bQ8C7N7 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Aph1bQ8C7N7 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Aph1bQ8C7N7 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Aph1bQ8C7N7 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Aph1bQ8C7N7 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Aph1bQ8C7N7 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Aph1bQ8C7N7 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Aph1bQ8C7N7 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Aph1bQ8C7N7 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Aph1bQ8C7N7 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Aph1bQ8C7N7 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Aph1bQ8C7N7 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Aph1bQ8C7N7 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Aph1bQ8C7N7 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Aph1bQ8C7N7 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Aph1bQ8C7N7 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Aph1bQ8C7N7 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Aph1bQ8C7N7 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Aph1bQ8C7N7 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Aph1bQ8C7N7 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Aph1bQ8C7N7 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Aph1bQ8C7N7 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Aph1bQ8C7N7 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Aph1bQ8C7N7 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Aph1bQ8C7N7 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Aph1bQ8C7N7 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Aph1bQ8C7N7 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Aph1bQ8C7N7 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Aph1bQ8C7N7 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Aph1bQ8C7N7 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Aph1bQ8C7N7 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Aph1bQ8C7N7 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Aph1bQ8C7N7 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Aph1bQ8C7N7 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Aph1bQ8C7N7 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Aph1bQ8C7N7 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Aph1bQ8C7N7 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Aph1bQ8C7N7 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Aph1bQ8C7N7 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Aph1bQ8C7N7 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Aph1bQ8C7N7 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Aph1bQ8C7N7 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Aph1bQ8C7N7 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Aph1bQ8C7N7 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Aph1bQ8C7N7 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Aph1bQ8C7N7 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Aph1bQ8C7N7 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Aph1bQ8C7N7 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Aph1bQ8C7N7 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Aph1bQ8C7N7 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Aph1bQ8C7N7 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Aph1bQ8C7N7 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Aph1bQ8C7N7 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Aph1bQ8C7N7 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Aph1bQ8C7N7 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Aph1bQ8C7N7 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Aph1bQ8C7N7 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Aph1bQ8C7N7 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Aph1bQ8C7N7 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Aph1bQ8C7N7 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Aph1bQ8C7N7 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Aph1bQ8C7N7 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Aph1bQ8C7N7 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Aph1bQ8C7N7 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Aph1bQ8C7N7 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Aph1bQ8C7N7 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Aph1bQ8C7N7 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Aph1bQ8C7N7 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Aph1bQ8C7N7 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Aph1bQ8C7N7 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Aph1bQ8C7N7 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Aph1bQ8C7N7 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Aph1bQ8C7N7 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Aph1bQ8C7N7 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Aph1bQ8C7N7 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Aph1bQ8C7N7 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Aph1bQ8C7N7 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Aph1bQ8C7N7 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Aph1bQ8C7N7 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Aph1bQ8C7N7 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Aph1bQ8C7N7 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Aph1bQ8C7N7 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Aph1bQ8C7N7 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Aph1bQ8C7N7 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Aph1bQ8C7N7 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Aph1bQ8C7N7 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Aph1bQ8C7N7 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Aph1bQ8C7N7 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Aph1bQ8C7N7 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Aph1bQ8C7N7 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Aph1bQ8C7N7 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Aph1bQ8C7N7 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Aph1bQ8C7N7 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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