Protein–RNA interactions for Protein: Q8C735

Lin9, Protein lin-9 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin9Q8C735 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lin9Q8C735 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lin9Q8C735 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lin9Q8C735 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lin9Q8C735 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lin9Q8C735 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lin9Q8C735 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lin9Q8C735 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lin9Q8C735 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lin9Q8C735 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lin9Q8C735 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Lin9Q8C735 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Lin9Q8C735 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Lin9Q8C735 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lin9Q8C735 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Lin9Q8C735 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Lin9Q8C735 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Lin9Q8C735 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lin9Q8C735 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lin9Q8C735 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lin9Q8C735 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lin9Q8C735 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lin9Q8C735 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lin9Q8C735 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lin9Q8C735 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lin9Q8C735 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lin9Q8C735 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Lin9Q8C735 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lin9Q8C735 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lin9Q8C735 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lin9Q8C735 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lin9Q8C735 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lin9Q8C735 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lin9Q8C735 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lin9Q8C735 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lin9Q8C735 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lin9Q8C735 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lin9Q8C735 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lin9Q8C735 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lin9Q8C735 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lin9Q8C735 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lin9Q8C735 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lin9Q8C735 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lin9Q8C735 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lin9Q8C735 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Lin9Q8C735 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Lin9Q8C735 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Lin9Q8C735 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Lin9Q8C735 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lin9Q8C735 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Lin9Q8C735 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lin9Q8C735 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Lin9Q8C735 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lin9Q8C735 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Lin9Q8C735 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lin9Q8C735 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lin9Q8C735 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lin9Q8C735 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lin9Q8C735 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Lin9Q8C735 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lin9Q8C735 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lin9Q8C735 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lin9Q8C735 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lin9Q8C735 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lin9Q8C735 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lin9Q8C735 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lin9Q8C735 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lin9Q8C735 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lin9Q8C735 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lin9Q8C735 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lin9Q8C735 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lin9Q8C735 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lin9Q8C735 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lin9Q8C735 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lin9Q8C735 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lin9Q8C735 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lin9Q8C735 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lin9Q8C735 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Lin9Q8C735 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lin9Q8C735 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lin9Q8C735 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lin9Q8C735 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Lin9Q8C735 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lin9Q8C735 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lin9Q8C735 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lin9Q8C735 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lin9Q8C735 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lin9Q8C735 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lin9Q8C735 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lin9Q8C735 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lin9Q8C735 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lin9Q8C735 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lin9Q8C735 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lin9Q8C735 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lin9Q8C735 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lin9Q8C735 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lin9Q8C735 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lin9Q8C735 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lin9Q8C735 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lin9Q8C735 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms