Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

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Length 607 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg16l1Q8C0J2 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg16l1Q8C0J2 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg16l1Q8C0J2 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg16l1Q8C0J2 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg16l1Q8C0J2 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg16l1Q8C0J2 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg16l1Q8C0J2 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg16l1Q8C0J2 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg16l1Q8C0J2 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg16l1Q8C0J2 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg16l1Q8C0J2 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg16l1Q8C0J2 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg16l1Q8C0J2 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg16l1Q8C0J2 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg16l1Q8C0J2 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg16l1Q8C0J2 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg16l1Q8C0J2 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg16l1Q8C0J2 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg16l1Q8C0J2 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg16l1Q8C0J2 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg16l1Q8C0J2 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg16l1Q8C0J2 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg16l1Q8C0J2 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg16l1Q8C0J2 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg16l1Q8C0J2 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg16l1Q8C0J2 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg16l1Q8C0J2 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg16l1Q8C0J2 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg16l1Q8C0J2 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg16l1Q8C0J2 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg16l1Q8C0J2 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg16l1Q8C0J2 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg16l1Q8C0J2 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg16l1Q8C0J2 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg16l1Q8C0J2 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg16l1Q8C0J2 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg16l1Q8C0J2 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg16l1Q8C0J2 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg16l1Q8C0J2 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg16l1Q8C0J2 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg16l1Q8C0J2 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg16l1Q8C0J2 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg16l1Q8C0J2 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg16l1Q8C0J2 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg16l1Q8C0J2 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg16l1Q8C0J2 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg16l1Q8C0J2 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg16l1Q8C0J2 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg16l1Q8C0J2 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg16l1Q8C0J2 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg16l1Q8C0J2 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg16l1Q8C0J2 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg16l1Q8C0J2 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg16l1Q8C0J2 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg16l1Q8C0J2 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg16l1Q8C0J2 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg16l1Q8C0J2 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg16l1Q8C0J2 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg16l1Q8C0J2 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg16l1Q8C0J2 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg16l1Q8C0J2 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg16l1Q8C0J2 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg16l1Q8C0J2 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg16l1Q8C0J2 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg16l1Q8C0J2 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Atg16l1Q8C0J2 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg16l1Q8C0J2 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg16l1Q8C0J2 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg16l1Q8C0J2 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg16l1Q8C0J2 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg16l1Q8C0J2 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg16l1Q8C0J2 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg16l1Q8C0J2 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg16l1Q8C0J2 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg16l1Q8C0J2 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg16l1Q8C0J2 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg16l1Q8C0J2 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg16l1Q8C0J2 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg16l1Q8C0J2 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg16l1Q8C0J2 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg16l1Q8C0J2 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg16l1Q8C0J2 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg16l1Q8C0J2 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg16l1Q8C0J2 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg16l1Q8C0J2 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atg16l1Q8C0J2 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg16l1Q8C0J2 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg16l1Q8C0J2 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg16l1Q8C0J2 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg16l1Q8C0J2 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg16l1Q8C0J2 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg16l1Q8C0J2 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg16l1Q8C0J2 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg16l1Q8C0J2 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg16l1Q8C0J2 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg16l1Q8C0J2 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg16l1Q8C0J2 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg16l1Q8C0J2 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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