Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXS2

Tnfsfm13, Tumor necrosis factor (ligand) superfamily, membrane-bound member 13, mousemouse

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Length 410 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsfm13Q8BXS2 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfsfm13Q8BXS2 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfsfm13Q8BXS2 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfsfm13Q8BXS2 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfsfm13Q8BXS2 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfsfm13Q8BXS2 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfsfm13Q8BXS2 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfsfm13Q8BXS2 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfsfm13Q8BXS2 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfsfm13Q8BXS2 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfsfm13Q8BXS2 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfsfm13Q8BXS2 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfsfm13Q8BXS2 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfsfm13Q8BXS2 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfsfm13Q8BXS2 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Tnfsfm13Q8BXS2 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfsfm13Q8BXS2 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfsfm13Q8BXS2 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfsfm13Q8BXS2 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfsfm13Q8BXS2 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfsfm13Q8BXS2 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfsfm13Q8BXS2 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfsfm13Q8BXS2 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfsfm13Q8BXS2 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfsfm13Q8BXS2 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfsfm13Q8BXS2 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Tnfsfm13Q8BXS2 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfsfm13Q8BXS2 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Tnfsfm13Q8BXS2 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Tnfsfm13Q8BXS2 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfsfm13Q8BXS2 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Tnfsfm13Q8BXS2 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfsfm13Q8BXS2 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Tnfsfm13Q8BXS2 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfsfm13Q8BXS2 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfsfm13Q8BXS2 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfsfm13Q8BXS2 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfsfm13Q8BXS2 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Tnfsfm13Q8BXS2 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfsfm13Q8BXS2 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Tnfsfm13Q8BXS2 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfsfm13Q8BXS2 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfsfm13Q8BXS2 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfsfm13Q8BXS2 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfsfm13Q8BXS2 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfsfm13Q8BXS2 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfsfm13Q8BXS2 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfsfm13Q8BXS2 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfsfm13Q8BXS2 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfsfm13Q8BXS2 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Tnfsfm13Q8BXS2 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfsfm13Q8BXS2 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfsfm13Q8BXS2 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnfsfm13Q8BXS2 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnfsfm13Q8BXS2 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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