Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXA6

Cldn17, Claudin-17, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn17Q8BXA6 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
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