Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVA4

Lmod1, Leiomodin-1, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod1Q8BVA4 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lmod1Q8BVA4 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lmod1Q8BVA4 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lmod1Q8BVA4 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lmod1Q8BVA4 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lmod1Q8BVA4 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lmod1Q8BVA4 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lmod1Q8BVA4 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lmod1Q8BVA4 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Lmod1Q8BVA4 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Lmod1Q8BVA4 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Lmod1Q8BVA4 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Lmod1Q8BVA4 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lmod1Q8BVA4 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lmod1Q8BVA4 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lmod1Q8BVA4 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lmod1Q8BVA4 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lmod1Q8BVA4 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lmod1Q8BVA4 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lmod1Q8BVA4 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lmod1Q8BVA4 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lmod1Q8BVA4 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lmod1Q8BVA4 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Lmod1Q8BVA4 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lmod1Q8BVA4 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Lmod1Q8BVA4 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Lmod1Q8BVA4 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lmod1Q8BVA4 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lmod1Q8BVA4 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lmod1Q8BVA4 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lmod1Q8BVA4 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lmod1Q8BVA4 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lmod1Q8BVA4 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lmod1Q8BVA4 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lmod1Q8BVA4 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lmod1Q8BVA4 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lmod1Q8BVA4 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lmod1Q8BVA4 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lmod1Q8BVA4 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lmod1Q8BVA4 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lmod1Q8BVA4 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lmod1Q8BVA4 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lmod1Q8BVA4 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lmod1Q8BVA4 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lmod1Q8BVA4 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lmod1Q8BVA4 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lmod1Q8BVA4 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lmod1Q8BVA4 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lmod1Q8BVA4 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lmod1Q8BVA4 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lmod1Q8BVA4 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lmod1Q8BVA4 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lmod1Q8BVA4 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lmod1Q8BVA4 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lmod1Q8BVA4 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lmod1Q8BVA4 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Lmod1Q8BVA4 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Lmod1Q8BVA4 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lmod1Q8BVA4 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lmod1Q8BVA4 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lmod1Q8BVA4 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lmod1Q8BVA4 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lmod1Q8BVA4 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lmod1Q8BVA4 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lmod1Q8BVA4 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lmod1Q8BVA4 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lmod1Q8BVA4 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lmod1Q8BVA4 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lmod1Q8BVA4 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lmod1Q8BVA4 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lmod1Q8BVA4 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lmod1Q8BVA4 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lmod1Q8BVA4 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lmod1Q8BVA4 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lmod1Q8BVA4 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lmod1Q8BVA4 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lmod1Q8BVA4 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lmod1Q8BVA4 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lmod1Q8BVA4 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Lmod1Q8BVA4 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lmod1Q8BVA4 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lmod1Q8BVA4 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lmod1Q8BVA4 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lmod1Q8BVA4 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lmod1Q8BVA4 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Lmod1Q8BVA4 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lmod1Q8BVA4 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lmod1Q8BVA4 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lmod1Q8BVA4 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lmod1Q8BVA4 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lmod1Q8BVA4 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lmod1Q8BVA4 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lmod1Q8BVA4 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lmod1Q8BVA4 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Lmod1Q8BVA4 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lmod1Q8BVA4 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lmod1Q8BVA4 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lmod1Q8BVA4 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lmod1Q8BVA4 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lmod1Q8BVA4 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms