Protein–RNA interactions for Protein: Q8BRE0

Rd3, Protein RD3, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3Q8BRE0 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rd3Q8BRE0 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rd3Q8BRE0 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rd3Q8BRE0 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rd3Q8BRE0 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rd3Q8BRE0 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rd3Q8BRE0 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rd3Q8BRE0 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rd3Q8BRE0 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rd3Q8BRE0 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rd3Q8BRE0 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rd3Q8BRE0 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rd3Q8BRE0 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rd3Q8BRE0 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rd3Q8BRE0 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rd3Q8BRE0 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rd3Q8BRE0 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rd3Q8BRE0 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rd3Q8BRE0 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rd3Q8BRE0 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rd3Q8BRE0 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rd3Q8BRE0 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rd3Q8BRE0 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rd3Q8BRE0 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rd3Q8BRE0 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rd3Q8BRE0 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rd3Q8BRE0 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rd3Q8BRE0 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rd3Q8BRE0 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rd3Q8BRE0 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rd3Q8BRE0 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rd3Q8BRE0 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rd3Q8BRE0 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rd3Q8BRE0 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rd3Q8BRE0 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rd3Q8BRE0 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rd3Q8BRE0 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rd3Q8BRE0 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms