Protein–RNA interactions for Protein: Q8BP27

Sfr1, Swi5-dependent recombination DNA repair protein 1 homolog, mousemouse

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfr1Q8BP27 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sfr1Q8BP27 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sfr1Q8BP27 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sfr1Q8BP27 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Sfr1Q8BP27 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sfr1Q8BP27 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sfr1Q8BP27 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sfr1Q8BP27 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sfr1Q8BP27 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sfr1Q8BP27 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sfr1Q8BP27 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sfr1Q8BP27 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Sfr1Q8BP27 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Sfr1Q8BP27 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Sfr1Q8BP27 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Sfr1Q8BP27 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sfr1Q8BP27 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sfr1Q8BP27 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Sfr1Q8BP27 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Sfr1Q8BP27 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Sfr1Q8BP27 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Sfr1Q8BP27 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Sfr1Q8BP27 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sfr1Q8BP27 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sfr1Q8BP27 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Sfr1Q8BP27 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sfr1Q8BP27 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sfr1Q8BP27 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sfr1Q8BP27 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Sfr1Q8BP27 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Sfr1Q8BP27 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sfr1Q8BP27 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sfr1Q8BP27 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sfr1Q8BP27 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sfr1Q8BP27 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sfr1Q8BP27 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Sfr1Q8BP27 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sfr1Q8BP27 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sfr1Q8BP27 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sfr1Q8BP27 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Sfr1Q8BP27 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sfr1Q8BP27 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sfr1Q8BP27 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sfr1Q8BP27 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sfr1Q8BP27 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sfr1Q8BP27 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sfr1Q8BP27 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sfr1Q8BP27 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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