Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI3

Gga3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga3Q8BMI3 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gga3Q8BMI3 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gga3Q8BMI3 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gga3Q8BMI3 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gga3Q8BMI3 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gga3Q8BMI3 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gga3Q8BMI3 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gga3Q8BMI3 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gga3Q8BMI3 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gga3Q8BMI3 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gga3Q8BMI3 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gga3Q8BMI3 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gga3Q8BMI3 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gga3Q8BMI3 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gga3Q8BMI3 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gga3Q8BMI3 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gga3Q8BMI3 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gga3Q8BMI3 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gga3Q8BMI3 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gga3Q8BMI3 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gga3Q8BMI3 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gga3Q8BMI3 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gga3Q8BMI3 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gga3Q8BMI3 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gga3Q8BMI3 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gga3Q8BMI3 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gga3Q8BMI3 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gga3Q8BMI3 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gga3Q8BMI3 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gga3Q8BMI3 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gga3Q8BMI3 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gga3Q8BMI3 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gga3Q8BMI3 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gga3Q8BMI3 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gga3Q8BMI3 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gga3Q8BMI3 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gga3Q8BMI3 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gga3Q8BMI3 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gga3Q8BMI3 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gga3Q8BMI3 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gga3Q8BMI3 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gga3Q8BMI3 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gga3Q8BMI3 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gga3Q8BMI3 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gga3Q8BMI3 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gga3Q8BMI3 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gga3Q8BMI3 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gga3Q8BMI3 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gga3Q8BMI3 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gga3Q8BMI3 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gga3Q8BMI3 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gga3Q8BMI3 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Gga3Q8BMI3 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gga3Q8BMI3 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gga3Q8BMI3 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gga3Q8BMI3 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gga3Q8BMI3 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gga3Q8BMI3 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gga3Q8BMI3 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gga3Q8BMI3 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gga3Q8BMI3 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gga3Q8BMI3 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Gga3Q8BMI3 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gga3Q8BMI3 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gga3Q8BMI3 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gga3Q8BMI3 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gga3Q8BMI3 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gga3Q8BMI3 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gga3Q8BMI3 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gga3Q8BMI3 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gga3Q8BMI3 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Gga3Q8BMI3 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gga3Q8BMI3 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gga3Q8BMI3 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gga3Q8BMI3 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gga3Q8BMI3 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gga3Q8BMI3 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gga3Q8BMI3 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gga3Q8BMI3 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gga3Q8BMI3 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gga3Q8BMI3 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gga3Q8BMI3 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gga3Q8BMI3 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gga3Q8BMI3 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gga3Q8BMI3 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gga3Q8BMI3 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gga3Q8BMI3 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gga3Q8BMI3 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gga3Q8BMI3 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gga3Q8BMI3 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gga3Q8BMI3 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gga3Q8BMI3 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gga3Q8BMI3 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gga3Q8BMI3 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gga3Q8BMI3 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gga3Q8BMI3 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gga3Q8BMI3 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gga3Q8BMI3 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gga3Q8BMI3 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gga3Q8BMI3 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms