Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL74

Gtf3c2, General transcription factor 3C polypeptide 2, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c2Q8BL74 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf3c2Q8BL74 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf3c2Q8BL74 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf3c2Q8BL74 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf3c2Q8BL74 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf3c2Q8BL74 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf3c2Q8BL74 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf3c2Q8BL74 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf3c2Q8BL74 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf3c2Q8BL74 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf3c2Q8BL74 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf3c2Q8BL74 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf3c2Q8BL74 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf3c2Q8BL74 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf3c2Q8BL74 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf3c2Q8BL74 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf3c2Q8BL74 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf3c2Q8BL74 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf3c2Q8BL74 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf3c2Q8BL74 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf3c2Q8BL74 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf3c2Q8BL74 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf3c2Q8BL74 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf3c2Q8BL74 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf3c2Q8BL74 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf3c2Q8BL74 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf3c2Q8BL74 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf3c2Q8BL74 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf3c2Q8BL74 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf3c2Q8BL74 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf3c2Q8BL74 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf3c2Q8BL74 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf3c2Q8BL74 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf3c2Q8BL74 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf3c2Q8BL74 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf3c2Q8BL74 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf3c2Q8BL74 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf3c2Q8BL74 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf3c2Q8BL74 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf3c2Q8BL74 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf3c2Q8BL74 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf3c2Q8BL74 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf3c2Q8BL74 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Gtf3c2Q8BL74 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf3c2Q8BL74 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf3c2Q8BL74 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf3c2Q8BL74 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf3c2Q8BL74 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf3c2Q8BL74 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf3c2Q8BL74 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf3c2Q8BL74 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf3c2Q8BL74 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf3c2Q8BL74 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf3c2Q8BL74 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf3c2Q8BL74 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Gtf3c2Q8BL74 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf3c2Q8BL74 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf3c2Q8BL74 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf3c2Q8BL74 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf3c2Q8BL74 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Gtf3c2Q8BL74 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf3c2Q8BL74 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf3c2Q8BL74 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf3c2Q8BL74 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf3c2Q8BL74 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf3c2Q8BL74 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf3c2Q8BL74 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf3c2Q8BL74 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf3c2Q8BL74 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf3c2Q8BL74 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf3c2Q8BL74 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf3c2Q8BL74 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf3c2Q8BL74 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf3c2Q8BL74 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf3c2Q8BL74 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf3c2Q8BL74 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf3c2Q8BL74 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf3c2Q8BL74 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf3c2Q8BL74 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf3c2Q8BL74 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf3c2Q8BL74 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf3c2Q8BL74 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf3c2Q8BL74 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf3c2Q8BL74 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf3c2Q8BL74 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf3c2Q8BL74 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf3c2Q8BL74 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf3c2Q8BL74 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf3c2Q8BL74 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf3c2Q8BL74 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf3c2Q8BL74 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf3c2Q8BL74 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf3c2Q8BL74 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf3c2Q8BL74 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf3c2Q8BL74 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf3c2Q8BL74 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms