Protein–RNA interactions for Protein: Q8BK06

Fbxo9, F-box only protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo9Q8BK06 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fbxo9Q8BK06 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fbxo9Q8BK06 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fbxo9Q8BK06 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Fbxo9Q8BK06 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fbxo9Q8BK06 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fbxo9Q8BK06 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fbxo9Q8BK06 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fbxo9Q8BK06 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fbxo9Q8BK06 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Fbxo9Q8BK06 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Fbxo9Q8BK06 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Fbxo9Q8BK06 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Fbxo9Q8BK06 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Fbxo9Q8BK06 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fbxo9Q8BK06 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fbxo9Q8BK06 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fbxo9Q8BK06 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fbxo9Q8BK06 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Fbxo9Q8BK06 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Fbxo9Q8BK06 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
Fbxo9Q8BK06 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Fbxo9Q8BK06 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Fbxo9Q8BK06 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Fbxo9Q8BK06 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Fbxo9Q8BK06 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fbxo9Q8BK06 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fbxo9Q8BK06 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fbxo9Q8BK06 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fbxo9Q8BK06 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fbxo9Q8BK06 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fbxo9Q8BK06 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fbxo9Q8BK06 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fbxo9Q8BK06 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fbxo9Q8BK06 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fbxo9Q8BK06 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fbxo9Q8BK06 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Fbxo9Q8BK06 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fbxo9Q8BK06 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fbxo9Q8BK06 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fbxo9Q8BK06 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fbxo9Q8BK06 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Fbxo9Q8BK06 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fbxo9Q8BK06 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Fbxo9Q8BK06 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fbxo9Q8BK06 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fbxo9Q8BK06 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fbxo9Q8BK06 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fbxo9Q8BK06 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fbxo9Q8BK06 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Fbxo9Q8BK06 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fbxo9Q8BK06 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fbxo9Q8BK06 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fbxo9Q8BK06 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fbxo9Q8BK06 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fbxo9Q8BK06 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fbxo9Q8BK06 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fbxo9Q8BK06 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fbxo9Q8BK06 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fbxo9Q8BK06 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fbxo9Q8BK06 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fbxo9Q8BK06 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fbxo9Q8BK06 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fbxo9Q8BK06 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fbxo9Q8BK06 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fbxo9Q8BK06 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fbxo9Q8BK06 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Fbxo9Q8BK06 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Fbxo9Q8BK06 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Fbxo9Q8BK06 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Fbxo9Q8BK06 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fbxo9Q8BK06 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fbxo9Q8BK06 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Fbxo9Q8BK06 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fbxo9Q8BK06 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fbxo9Q8BK06 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fbxo9Q8BK06 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fbxo9Q8BK06 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fbxo9Q8BK06 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fbxo9Q8BK06 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fbxo9Q8BK06 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fbxo9Q8BK06 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fbxo9Q8BK06 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fbxo9Q8BK06 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fbxo9Q8BK06 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fbxo9Q8BK06 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fbxo9Q8BK06 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fbxo9Q8BK06 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fbxo9Q8BK06 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fbxo9Q8BK06 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fbxo9Q8BK06 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fbxo9Q8BK06 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fbxo9Q8BK06 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fbxo9Q8BK06 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fbxo9Q8BK06 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fbxo9Q8BK06 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fbxo9Q8BK06 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fbxo9Q8BK06 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fbxo9Q8BK06 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fbxo9Q8BK06 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms