Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHD4

Frmd3, FERM domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmd3Q8BHD4 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Frmd3Q8BHD4 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Frmd3Q8BHD4 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Frmd3Q8BHD4 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Frmd3Q8BHD4 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Frmd3Q8BHD4 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Frmd3Q8BHD4 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Frmd3Q8BHD4 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Frmd3Q8BHD4 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Frmd3Q8BHD4 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Frmd3Q8BHD4 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Frmd3Q8BHD4 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Frmd3Q8BHD4 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Frmd3Q8BHD4 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Frmd3Q8BHD4 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Frmd3Q8BHD4 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Frmd3Q8BHD4 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Frmd3Q8BHD4 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Frmd3Q8BHD4 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Frmd3Q8BHD4 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Frmd3Q8BHD4 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Frmd3Q8BHD4 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Frmd3Q8BHD4 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Frmd3Q8BHD4 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Frmd3Q8BHD4 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Frmd3Q8BHD4 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Frmd3Q8BHD4 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Frmd3Q8BHD4 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Frmd3Q8BHD4 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Frmd3Q8BHD4 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Frmd3Q8BHD4 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Frmd3Q8BHD4 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Frmd3Q8BHD4 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Frmd3Q8BHD4 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Frmd3Q8BHD4 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Frmd3Q8BHD4 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Frmd3Q8BHD4 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Frmd3Q8BHD4 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Frmd3Q8BHD4 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Frmd3Q8BHD4 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Frmd3Q8BHD4 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Frmd3Q8BHD4 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Frmd3Q8BHD4 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Frmd3Q8BHD4 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Frmd3Q8BHD4 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Frmd3Q8BHD4 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Frmd3Q8BHD4 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Frmd3Q8BHD4 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Frmd3Q8BHD4 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Frmd3Q8BHD4 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Frmd3Q8BHD4 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Frmd3Q8BHD4 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Frmd3Q8BHD4 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Frmd3Q8BHD4 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Frmd3Q8BHD4 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Frmd3Q8BHD4 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Frmd3Q8BHD4 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Frmd3Q8BHD4 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Frmd3Q8BHD4 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Frmd3Q8BHD4 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Frmd3Q8BHD4 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Frmd3Q8BHD4 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Frmd3Q8BHD4 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Frmd3Q8BHD4 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Frmd3Q8BHD4 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Frmd3Q8BHD4 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Frmd3Q8BHD4 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Frmd3Q8BHD4 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Frmd3Q8BHD4 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Frmd3Q8BHD4 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Frmd3Q8BHD4 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Frmd3Q8BHD4 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Frmd3Q8BHD4 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Frmd3Q8BHD4 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Frmd3Q8BHD4 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Frmd3Q8BHD4 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Frmd3Q8BHD4 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Frmd3Q8BHD4 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Frmd3Q8BHD4 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Frmd3Q8BHD4 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Frmd3Q8BHD4 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Frmd3Q8BHD4 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Frmd3Q8BHD4 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Frmd3Q8BHD4 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Frmd3Q8BHD4 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Frmd3Q8BHD4 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Frmd3Q8BHD4 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Frmd3Q8BHD4 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Frmd3Q8BHD4 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Frmd3Q8BHD4 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Frmd3Q8BHD4 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Frmd3Q8BHD4 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Frmd3Q8BHD4 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Frmd3Q8BHD4 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Frmd3Q8BHD4 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Frmd3Q8BHD4 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Frmd3Q8BHD4 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Frmd3Q8BHD4 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Frmd3Q8BHD4 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Frmd3Q8BHD4 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms