Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE7

Trim6, Tripartite motif-containing protein 6, mousemouse

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Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim6Q8BGE7 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim6Q8BGE7 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim6Q8BGE7 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim6Q8BGE7 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim6Q8BGE7 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim6Q8BGE7 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim6Q8BGE7 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim6Q8BGE7 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim6Q8BGE7 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim6Q8BGE7 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim6Q8BGE7 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim6Q8BGE7 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim6Q8BGE7 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim6Q8BGE7 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim6Q8BGE7 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim6Q8BGE7 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim6Q8BGE7 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim6Q8BGE7 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim6Q8BGE7 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim6Q8BGE7 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim6Q8BGE7 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim6Q8BGE7 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim6Q8BGE7 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim6Q8BGE7 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim6Q8BGE7 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim6Q8BGE7 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim6Q8BGE7 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim6Q8BGE7 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim6Q8BGE7 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim6Q8BGE7 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim6Q8BGE7 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim6Q8BGE7 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim6Q8BGE7 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim6Q8BGE7 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim6Q8BGE7 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim6Q8BGE7 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim6Q8BGE7 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim6Q8BGE7 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim6Q8BGE7 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim6Q8BGE7 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim6Q8BGE7 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim6Q8BGE7 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim6Q8BGE7 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim6Q8BGE7 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim6Q8BGE7 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim6Q8BGE7 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim6Q8BGE7 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim6Q8BGE7 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim6Q8BGE7 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim6Q8BGE7 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim6Q8BGE7 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim6Q8BGE7 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim6Q8BGE7 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim6Q8BGE7 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim6Q8BGE7 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim6Q8BGE7 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim6Q8BGE7 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim6Q8BGE7 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim6Q8BGE7 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim6Q8BGE7 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim6Q8BGE7 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim6Q8BGE7 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim6Q8BGE7 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim6Q8BGE7 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim6Q8BGE7 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim6Q8BGE7 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim6Q8BGE7 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim6Q8BGE7 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim6Q8BGE7 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim6Q8BGE7 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim6Q8BGE7 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim6Q8BGE7 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim6Q8BGE7 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim6Q8BGE7 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim6Q8BGE7 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim6Q8BGE7 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim6Q8BGE7 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim6Q8BGE7 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim6Q8BGE7 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim6Q8BGE7 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim6Q8BGE7 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim6Q8BGE7 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim6Q8BGE7 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim6Q8BGE7 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim6Q8BGE7 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim6Q8BGE7 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim6Q8BGE7 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim6Q8BGE7 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim6Q8BGE7 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim6Q8BGE7 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim6Q8BGE7 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim6Q8BGE7 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim6Q8BGE7 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim6Q8BGE7 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim6Q8BGE7 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim6Q8BGE7 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim6Q8BGE7 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim6Q8BGE7 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim6Q8BGE7 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim6Q8BGE7 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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