Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGD7

Npas4, Neuronal PAS domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas4Q8BGD7 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Npas4Q8BGD7 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Npas4Q8BGD7 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Npas4Q8BGD7 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Npas4Q8BGD7 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Npas4Q8BGD7 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Npas4Q8BGD7 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Npas4Q8BGD7 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Npas4Q8BGD7 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Npas4Q8BGD7 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Npas4Q8BGD7 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Npas4Q8BGD7 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Npas4Q8BGD7 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Npas4Q8BGD7 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Npas4Q8BGD7 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Npas4Q8BGD7 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Npas4Q8BGD7 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Npas4Q8BGD7 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Npas4Q8BGD7 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Npas4Q8BGD7 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Npas4Q8BGD7 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Npas4Q8BGD7 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Npas4Q8BGD7 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Npas4Q8BGD7 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Npas4Q8BGD7 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Npas4Q8BGD7 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Npas4Q8BGD7 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Npas4Q8BGD7 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Npas4Q8BGD7 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Npas4Q8BGD7 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Npas4Q8BGD7 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Npas4Q8BGD7 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Npas4Q8BGD7 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Npas4Q8BGD7 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Npas4Q8BGD7 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Npas4Q8BGD7 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Npas4Q8BGD7 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Npas4Q8BGD7 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Npas4Q8BGD7 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Npas4Q8BGD7 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Npas4Q8BGD7 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Npas4Q8BGD7 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Npas4Q8BGD7 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Npas4Q8BGD7 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Npas4Q8BGD7 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Npas4Q8BGD7 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Npas4Q8BGD7 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Npas4Q8BGD7 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Npas4Q8BGD7 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Npas4Q8BGD7 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Npas4Q8BGD7 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Npas4Q8BGD7 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Npas4Q8BGD7 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Npas4Q8BGD7 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Npas4Q8BGD7 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Npas4Q8BGD7 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Npas4Q8BGD7 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Npas4Q8BGD7 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Npas4Q8BGD7 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Npas4Q8BGD7 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Npas4Q8BGD7 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Npas4Q8BGD7 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Npas4Q8BGD7 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Npas4Q8BGD7 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Npas4Q8BGD7 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Npas4Q8BGD7 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Npas4Q8BGD7 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Npas4Q8BGD7 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Npas4Q8BGD7 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Npas4Q8BGD7 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Npas4Q8BGD7 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Npas4Q8BGD7 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Npas4Q8BGD7 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Npas4Q8BGD7 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Npas4Q8BGD7 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Npas4Q8BGD7 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Npas4Q8BGD7 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Npas4Q8BGD7 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Npas4Q8BGD7 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Npas4Q8BGD7 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Npas4Q8BGD7 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Npas4Q8BGD7 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Npas4Q8BGD7 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Npas4Q8BGD7 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Npas4Q8BGD7 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Npas4Q8BGD7 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Npas4Q8BGD7 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Npas4Q8BGD7 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Npas4Q8BGD7 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Npas4Q8BGD7 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Npas4Q8BGD7 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Npas4Q8BGD7 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Npas4Q8BGD7 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Npas4Q8BGD7 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Npas4Q8BGD7 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Npas4Q8BGD7 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Npas4Q8BGD7 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Npas4Q8BGD7 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Npas4Q8BGD7 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Npas4Q8BGD7 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms