Protein–RNA interactions for Protein: Q810U5

Ccdc50, Coiled-coil domain-containing protein 50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc50Q810U5 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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