Protein–RNA interactions for Protein: Q80SY5

Prpf38b, Pre-mRNA-splicing factor 38B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf38bQ80SY5 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Prpf38bQ80SY5 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms