Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSN2

Clm, CMRF35-like molecule, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmQ7TSN2 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Rpa3-201ENSMUST00000012627 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 5930422O12Rik-201ENSMUST00000059351 840 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Gm25318-201ENSMUST00000122554 314 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Gm5970-201ENSMUST00000131638 1216 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Irf2-209ENSMUST00000210218 535 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Gm35611-201ENSMUST00000205323 799 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Gm45079-201ENSMUST00000205627 461 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms