Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Actn1Q7TPR4 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Actn1Q7TPR4 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Actn1Q7TPR4 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Actn1Q7TPR4 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Actn1Q7TPR4 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Actn1Q7TPR4 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Actn1Q7TPR4 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Actn1Q7TPR4 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Actn1Q7TPR4 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Actn1Q7TPR4 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Actn1Q7TPR4 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Actn1Q7TPR4 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Actn1Q7TPR4 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Actn1Q7TPR4 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Actn1Q7TPR4 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Actn1Q7TPR4 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Actn1Q7TPR4 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Actn1Q7TPR4 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Actn1Q7TPR4 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Actn1Q7TPR4 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Actn1Q7TPR4 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Actn1Q7TPR4 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Actn1Q7TPR4 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Actn1Q7TPR4 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Actn1Q7TPR4 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Actn1Q7TPR4 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Actn1Q7TPR4 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Actn1Q7TPR4 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Actn1Q7TPR4 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Actn1Q7TPR4 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Actn1Q7TPR4 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Actn1Q7TPR4 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Actn1Q7TPR4 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Actn1Q7TPR4 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Actn1Q7TPR4 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Actn1Q7TPR4 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Actn1Q7TPR4 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Actn1Q7TPR4 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Actn1Q7TPR4 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Actn1Q7TPR4 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Actn1Q7TPR4 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Actn1Q7TPR4 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Actn1Q7TPR4 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Actn1Q7TPR4 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Actn1Q7TPR4 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Actn1Q7TPR4 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Actn1Q7TPR4 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Actn1Q7TPR4 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Actn1Q7TPR4 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Actn1Q7TPR4 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Actn1Q7TPR4 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Actn1Q7TPR4 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Actn1Q7TPR4 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Actn1Q7TPR4 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Actn1Q7TPR4 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Actn1Q7TPR4 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Actn1Q7TPR4 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Actn1Q7TPR4 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Actn1Q7TPR4 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Actn1Q7TPR4 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Actn1Q7TPR4 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Actn1Q7TPR4 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Actn1Q7TPR4 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Actn1Q7TPR4 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Actn1Q7TPR4 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Actn1Q7TPR4 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Actn1Q7TPR4 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Actn1Q7TPR4 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Actn1Q7TPR4 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Actn1Q7TPR4 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Actn1Q7TPR4 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Actn1Q7TPR4 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Actn1Q7TPR4 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Actn1Q7TPR4 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
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Actn1Q7TPR4 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Actn1Q7TPR4 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Actn1Q7TPR4 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Actn1Q7TPR4 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Actn1Q7TPR4 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Actn1Q7TPR4 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Actn1Q7TPR4 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Actn1Q7TPR4 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Actn1Q7TPR4 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Actn1Q7TPR4 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Actn1Q7TPR4 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Actn1Q7TPR4 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Actn1Q7TPR4 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Actn1Q7TPR4 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Actn1Q7TPR4 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Actn1Q7TPR4 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Actn1Q7TPR4 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Actn1Q7TPR4 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Actn1Q7TPR4 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Actn1Q7TPR4 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Actn1Q7TPR4 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Actn1Q7TPR4 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Actn1Q7TPR4 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Actn1Q7TPR4 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
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