Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNH6

Nphp3, Nephrocystin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp3Q7TNH6 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nphp3Q7TNH6 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nphp3Q7TNH6 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nphp3Q7TNH6 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nphp3Q7TNH6 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nphp3Q7TNH6 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Nphp3Q7TNH6 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nphp3Q7TNH6 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Nphp3Q7TNH6 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Nphp3Q7TNH6 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nphp3Q7TNH6 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nphp3Q7TNH6 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nphp3Q7TNH6 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nphp3Q7TNH6 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nphp3Q7TNH6 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nphp3Q7TNH6 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nphp3Q7TNH6 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nphp3Q7TNH6 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nphp3Q7TNH6 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nphp3Q7TNH6 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nphp3Q7TNH6 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nphp3Q7TNH6 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nphp3Q7TNH6 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nphp3Q7TNH6 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nphp3Q7TNH6 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nphp3Q7TNH6 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nphp3Q7TNH6 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nphp3Q7TNH6 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nphp3Q7TNH6 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nphp3Q7TNH6 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Nphp3Q7TNH6 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nphp3Q7TNH6 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nphp3Q7TNH6 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nphp3Q7TNH6 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nphp3Q7TNH6 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nphp3Q7TNH6 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nphp3Q7TNH6 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nphp3Q7TNH6 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nphp3Q7TNH6 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nphp3Q7TNH6 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nphp3Q7TNH6 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nphp3Q7TNH6 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nphp3Q7TNH6 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nphp3Q7TNH6 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nphp3Q7TNH6 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nphp3Q7TNH6 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Nphp3Q7TNH6 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nphp3Q7TNH6 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nphp3Q7TNH6 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nphp3Q7TNH6 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nphp3Q7TNH6 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Nphp3Q7TNH6 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nphp3Q7TNH6 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nphp3Q7TNH6 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nphp3Q7TNH6 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nphp3Q7TNH6 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nphp3Q7TNH6 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nphp3Q7TNH6 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nphp3Q7TNH6 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Nphp3Q7TNH6 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nphp3Q7TNH6 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nphp3Q7TNH6 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nphp3Q7TNH6 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nphp3Q7TNH6 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nphp3Q7TNH6 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nphp3Q7TNH6 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nphp3Q7TNH6 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nphp3Q7TNH6 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nphp3Q7TNH6 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nphp3Q7TNH6 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nphp3Q7TNH6 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nphp3Q7TNH6 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nphp3Q7TNH6 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nphp3Q7TNH6 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nphp3Q7TNH6 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nphp3Q7TNH6 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Nphp3Q7TNH6 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nphp3Q7TNH6 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nphp3Q7TNH6 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nphp3Q7TNH6 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nphp3Q7TNH6 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nphp3Q7TNH6 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nphp3Q7TNH6 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nphp3Q7TNH6 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Nphp3Q7TNH6 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nphp3Q7TNH6 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Nphp3Q7TNH6 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Nphp3Q7TNH6 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nphp3Q7TNH6 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nphp3Q7TNH6 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nphp3Q7TNH6 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nphp3Q7TNH6 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nphp3Q7TNH6 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nphp3Q7TNH6 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nphp3Q7TNH6 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nphp3Q7TNH6 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nphp3Q7TNH6 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nphp3Q7TNH6 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nphp3Q7TNH6 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nphp3Q7TNH6 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms