Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN58

Tmc8, Transmembrane channel-like protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmc8Q7TN58 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmc8Q7TN58 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmc8Q7TN58 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmc8Q7TN58 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmc8Q7TN58 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmc8Q7TN58 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmc8Q7TN58 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmc8Q7TN58 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmc8Q7TN58 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmc8Q7TN58 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmc8Q7TN58 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmc8Q7TN58 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmc8Q7TN58 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmc8Q7TN58 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmc8Q7TN58 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmc8Q7TN58 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmc8Q7TN58 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmc8Q7TN58 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmc8Q7TN58 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmc8Q7TN58 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmc8Q7TN58 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmc8Q7TN58 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmc8Q7TN58 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmc8Q7TN58 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmc8Q7TN58 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmc8Q7TN58 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmc8Q7TN58 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmc8Q7TN58 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmc8Q7TN58 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmc8Q7TN58 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmc8Q7TN58 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmc8Q7TN58 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmc8Q7TN58 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmc8Q7TN58 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmc8Q7TN58 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmc8Q7TN58 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmc8Q7TN58 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmc8Q7TN58 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmc8Q7TN58 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmc8Q7TN58 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmc8Q7TN58 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmc8Q7TN58 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmc8Q7TN58 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmc8Q7TN58 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmc8Q7TN58 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmc8Q7TN58 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmc8Q7TN58 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmc8Q7TN58 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmc8Q7TN58 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmc8Q7TN58 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmc8Q7TN58 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmc8Q7TN58 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmc8Q7TN58 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmc8Q7TN58 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmc8Q7TN58 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmc8Q7TN58 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmc8Q7TN58 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmc8Q7TN58 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmc8Q7TN58 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmc8Q7TN58 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmc8Q7TN58 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmc8Q7TN58 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmc8Q7TN58 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmc8Q7TN58 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tmc8Q7TN58 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tmc8Q7TN58 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tmc8Q7TN58 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmc8Q7TN58 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmc8Q7TN58 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmc8Q7TN58 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmc8Q7TN58 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmc8Q7TN58 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmc8Q7TN58 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmc8Q7TN58 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmc8Q7TN58 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmc8Q7TN58 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmc8Q7TN58 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmc8Q7TN58 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmc8Q7TN58 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmc8Q7TN58 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmc8Q7TN58 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmc8Q7TN58 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmc8Q7TN58 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmc8Q7TN58 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmc8Q7TN58 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmc8Q7TN58 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmc8Q7TN58 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmc8Q7TN58 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmc8Q7TN58 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmc8Q7TN58 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmc8Q7TN58 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmc8Q7TN58 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmc8Q7TN58 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmc8Q7TN58 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmc8Q7TN58 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmc8Q7TN58 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmc8Q7TN58 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmc8Q7TN58 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmc8Q7TN58 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmc8Q7TN58 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms