Protein–RNA interactions for Protein: Q78YZ6

Scoc, Short coiled-coil protein, mousemouse

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Length 125 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScocQ78YZ6 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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