Protein–RNA interactions for Protein: Q78JN3

Eci3, Enoyl-CoA delta isomerase 3, peroxisomal, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eci3Q78JN3 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Eci3Q78JN3 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Eci3Q78JN3 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Eci3Q78JN3 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Eci3Q78JN3 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Eci3Q78JN3 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Eci3Q78JN3 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Eci3Q78JN3 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Eci3Q78JN3 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Eci3Q78JN3 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Eci3Q78JN3 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Eci3Q78JN3 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Eci3Q78JN3 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Eci3Q78JN3 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Eci3Q78JN3 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Eci3Q78JN3 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Eci3Q78JN3 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Eci3Q78JN3 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Eci3Q78JN3 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Eci3Q78JN3 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Eci3Q78JN3 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Eci3Q78JN3 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Eci3Q78JN3 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Eci3Q78JN3 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Eci3Q78JN3 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Eci3Q78JN3 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Eci3Q78JN3 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Eci3Q78JN3 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Eci3Q78JN3 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Eci3Q78JN3 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Eci3Q78JN3 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Eci3Q78JN3 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Eci3Q78JN3 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Eci3Q78JN3 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Eci3Q78JN3 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Eci3Q78JN3 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Eci3Q78JN3 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Eci3Q78JN3 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Eci3Q78JN3 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Eci3Q78JN3 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Eci3Q78JN3 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Eci3Q78JN3 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Eci3Q78JN3 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Eci3Q78JN3 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Eci3Q78JN3 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Eci3Q78JN3 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Eci3Q78JN3 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Eci3Q78JN3 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Eci3Q78JN3 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Eci3Q78JN3 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Eci3Q78JN3 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Eci3Q78JN3 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Eci3Q78JN3 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Eci3Q78JN3 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Eci3Q78JN3 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Eci3Q78JN3 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Eci3Q78JN3 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Eci3Q78JN3 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Eci3Q78JN3 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Eci3Q78JN3 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Eci3Q78JN3 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Eci3Q78JN3 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Eci3Q78JN3 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Eci3Q78JN3 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Eci3Q78JN3 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Eci3Q78JN3 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Eci3Q78JN3 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Eci3Q78JN3 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Eci3Q78JN3 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Eci3Q78JN3 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Eci3Q78JN3 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Eci3Q78JN3 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Eci3Q78JN3 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Eci3Q78JN3 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Eci3Q78JN3 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Eci3Q78JN3 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Eci3Q78JN3 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Eci3Q78JN3 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Eci3Q78JN3 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Eci3Q78JN3 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Eci3Q78JN3 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Eci3Q78JN3 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Eci3Q78JN3 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Eci3Q78JN3 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Eci3Q78JN3 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Eci3Q78JN3 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Eci3Q78JN3 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Eci3Q78JN3 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Eci3Q78JN3 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Eci3Q78JN3 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Eci3Q78JN3 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Eci3Q78JN3 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Eci3Q78JN3 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Eci3Q78JN3 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Eci3Q78JN3 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Eci3Q78JN3 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Eci3Q78JN3 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Eci3Q78JN3 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Eci3Q78JN3 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Eci3Q78JN3 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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