Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp49Q6P9L4 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp49Q6P9L4 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp49Q6P9L4 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp49Q6P9L4 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp49Q6P9L4 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp49Q6P9L4 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp49Q6P9L4 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp49Q6P9L4 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp49Q6P9L4 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp49Q6P9L4 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp49Q6P9L4 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp49Q6P9L4 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp49Q6P9L4 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp49Q6P9L4 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp49Q6P9L4 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp49Q6P9L4 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp49Q6P9L4 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp49Q6P9L4 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp49Q6P9L4 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp49Q6P9L4 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp49Q6P9L4 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp49Q6P9L4 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp49Q6P9L4 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp49Q6P9L4 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp49Q6P9L4 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp49Q6P9L4 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp49Q6P9L4 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp49Q6P9L4 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp49Q6P9L4 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp49Q6P9L4 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp49Q6P9L4 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp49Q6P9L4 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp49Q6P9L4 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp49Q6P9L4 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp49Q6P9L4 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp49Q6P9L4 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp49Q6P9L4 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp49Q6P9L4 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp49Q6P9L4 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp49Q6P9L4 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp49Q6P9L4 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp49Q6P9L4 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp49Q6P9L4 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp49Q6P9L4 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp49Q6P9L4 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp49Q6P9L4 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp49Q6P9L4 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp49Q6P9L4 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp49Q6P9L4 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp49Q6P9L4 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp49Q6P9L4 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp49Q6P9L4 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp49Q6P9L4 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp49Q6P9L4 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp49Q6P9L4 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp49Q6P9L4 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp49Q6P9L4 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp49Q6P9L4 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp49Q6P9L4 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp49Q6P9L4 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp49Q6P9L4 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp49Q6P9L4 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp49Q6P9L4 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp49Q6P9L4 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp49Q6P9L4 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp49Q6P9L4 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp49Q6P9L4 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp49Q6P9L4 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp49Q6P9L4 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp49Q6P9L4 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp49Q6P9L4 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp49Q6P9L4 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp49Q6P9L4 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp49Q6P9L4 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp49Q6P9L4 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp49Q6P9L4 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp49Q6P9L4 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp49Q6P9L4 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp49Q6P9L4 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp49Q6P9L4 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp49Q6P9L4 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp49Q6P9L4 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp49Q6P9L4 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp49Q6P9L4 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp49Q6P9L4 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp49Q6P9L4 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp49Q6P9L4 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp49Q6P9L4 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp49Q6P9L4 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp49Q6P9L4 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp49Q6P9L4 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp49Q6P9L4 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp49Q6P9L4 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp49Q6P9L4 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp49Q6P9L4 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp49Q6P9L4 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp49Q6P9L4 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp49Q6P9L4 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp49Q6P9L4 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms