Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXK8

Asic1, Acid-sensing ion channel 1, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Asic1Q6NXK8 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Asic1Q6NXK8 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms