Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRT3

Parpbp, PCNA-interacting partner, mousemouse

Predictions only

Length 573 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParpbpQ6IRT3 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ParpbpQ6IRT3 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ParpbpQ6IRT3 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ParpbpQ6IRT3 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ParpbpQ6IRT3 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ParpbpQ6IRT3 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ParpbpQ6IRT3 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ParpbpQ6IRT3 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ParpbpQ6IRT3 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ParpbpQ6IRT3 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ParpbpQ6IRT3 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ParpbpQ6IRT3 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ParpbpQ6IRT3 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ParpbpQ6IRT3 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
ParpbpQ6IRT3 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
ParpbpQ6IRT3 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
ParpbpQ6IRT3 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
ParpbpQ6IRT3 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
ParpbpQ6IRT3 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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