Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZB0

Lrrcc1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrcc1Q69ZB0 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrcc1Q69ZB0 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrcc1Q69ZB0 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrcc1Q69ZB0 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrcc1Q69ZB0 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrcc1Q69ZB0 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrcc1Q69ZB0 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrcc1Q69ZB0 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrcc1Q69ZB0 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrcc1Q69ZB0 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrcc1Q69ZB0 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrcc1Q69ZB0 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrcc1Q69ZB0 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrcc1Q69ZB0 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrcc1Q69ZB0 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrcc1Q69ZB0 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrcc1Q69ZB0 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrcc1Q69ZB0 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrcc1Q69ZB0 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrcc1Q69ZB0 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrcc1Q69ZB0 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrcc1Q69ZB0 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrcc1Q69ZB0 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrcc1Q69ZB0 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrcc1Q69ZB0 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrcc1Q69ZB0 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrcc1Q69ZB0 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrcc1Q69ZB0 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrcc1Q69ZB0 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrcc1Q69ZB0 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrcc1Q69ZB0 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrcc1Q69ZB0 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrcc1Q69ZB0 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrcc1Q69ZB0 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrcc1Q69ZB0 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrcc1Q69ZB0 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrcc1Q69ZB0 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrcc1Q69ZB0 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrcc1Q69ZB0 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrcc1Q69ZB0 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrcc1Q69ZB0 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrcc1Q69ZB0 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrcc1Q69ZB0 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrcc1Q69ZB0 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrcc1Q69ZB0 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrcc1Q69ZB0 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrcc1Q69ZB0 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrcc1Q69ZB0 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrcc1Q69ZB0 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrcc1Q69ZB0 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrcc1Q69ZB0 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrcc1Q69ZB0 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrcc1Q69ZB0 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrcc1Q69ZB0 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrcc1Q69ZB0 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrcc1Q69ZB0 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrcc1Q69ZB0 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrcc1Q69ZB0 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrcc1Q69ZB0 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrcc1Q69ZB0 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrcc1Q69ZB0 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrcc1Q69ZB0 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrcc1Q69ZB0 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrcc1Q69ZB0 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrcc1Q69ZB0 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrcc1Q69ZB0 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrcc1Q69ZB0 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrcc1Q69ZB0 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrcc1Q69ZB0 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrcc1Q69ZB0 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrcc1Q69ZB0 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrcc1Q69ZB0 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrcc1Q69ZB0 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrcc1Q69ZB0 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrcc1Q69ZB0 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrcc1Q69ZB0 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrcc1Q69ZB0 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrcc1Q69ZB0 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrcc1Q69ZB0 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrcc1Q69ZB0 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrcc1Q69ZB0 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrcc1Q69ZB0 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrcc1Q69ZB0 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrcc1Q69ZB0 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrcc1Q69ZB0 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrcc1Q69ZB0 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrcc1Q69ZB0 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrcc1Q69ZB0 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrcc1Q69ZB0 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrcc1Q69ZB0 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrcc1Q69ZB0 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrcc1Q69ZB0 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrcc1Q69ZB0 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrcc1Q69ZB0 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrcc1Q69ZB0 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrcc1Q69ZB0 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrcc1Q69ZB0 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrcc1Q69ZB0 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrrcc1Q69ZB0 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrrcc1Q69ZB0 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms