Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD9

Kiaa1549, UPF0606 protein KIAA1549, mousemouse

Predictions only

Length 1,940 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kiaa1549Q68FD9 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Kiaa1549Q68FD9 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Kiaa1549Q68FD9 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Kiaa1549Q68FD9 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Kiaa1549Q68FD9 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Kiaa1549Q68FD9 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Kiaa1549Q68FD9 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Kiaa1549Q68FD9 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Kiaa1549Q68FD9 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Kiaa1549Q68FD9 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Kiaa1549Q68FD9 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Kiaa1549Q68FD9 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Kiaa1549Q68FD9 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Kiaa1549Q68FD9 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Kiaa1549Q68FD9 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Kiaa1549Q68FD9 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Kiaa1549Q68FD9 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Kiaa1549Q68FD9 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Kiaa1549Q68FD9 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Kiaa1549Q68FD9 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Kiaa1549Q68FD9 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Kiaa1549Q68FD9 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Kiaa1549Q68FD9 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Kiaa1549Q68FD9 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Kiaa1549Q68FD9 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Kiaa1549Q68FD9 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Kiaa1549Q68FD9 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Kiaa1549Q68FD9 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Kiaa1549Q68FD9 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Kiaa1549Q68FD9 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Kiaa1549Q68FD9 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Kiaa1549Q68FD9 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Kiaa1549Q68FD9 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Kiaa1549Q68FD9 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Kiaa1549Q68FD9 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Kiaa1549Q68FD9 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Kiaa1549Q68FD9 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Kiaa1549Q68FD9 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Kiaa1549Q68FD9 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Kiaa1549Q68FD9 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Kiaa1549Q68FD9 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Kiaa1549Q68FD9 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Kiaa1549Q68FD9 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Kiaa1549Q68FD9 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Kiaa1549Q68FD9 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Kiaa1549Q68FD9 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Kiaa1549Q68FD9 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Kiaa1549Q68FD9 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Kiaa1549Q68FD9 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Kiaa1549Q68FD9 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Kiaa1549Q68FD9 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Kiaa1549Q68FD9 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Kiaa1549Q68FD9 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Kiaa1549Q68FD9 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Kiaa1549Q68FD9 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Kiaa1549Q68FD9 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Kiaa1549Q68FD9 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Kiaa1549Q68FD9 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Kiaa1549Q68FD9 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Kiaa1549Q68FD9 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Kiaa1549Q68FD9 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Kiaa1549Q68FD9 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Kiaa1549Q68FD9 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Kiaa1549Q68FD9 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Kiaa1549Q68FD9 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Kiaa1549Q68FD9 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Kiaa1549Q68FD9 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Kiaa1549Q68FD9 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Kiaa1549Q68FD9 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Kiaa1549Q68FD9 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Kiaa1549Q68FD9 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Kiaa1549Q68FD9 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Kiaa1549Q68FD9 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Kiaa1549Q68FD9 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Kiaa1549Q68FD9 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Kiaa1549Q68FD9 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Kiaa1549Q68FD9 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Kiaa1549Q68FD9 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Kiaa1549Q68FD9 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Kiaa1549Q68FD9 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Kiaa1549Q68FD9 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Kiaa1549Q68FD9 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Kiaa1549Q68FD9 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Kiaa1549Q68FD9 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Kiaa1549Q68FD9 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Kiaa1549Q68FD9 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Kiaa1549Q68FD9 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Kiaa1549Q68FD9 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Kiaa1549Q68FD9 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Kiaa1549Q68FD9 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Kiaa1549Q68FD9 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Kiaa1549Q68FD9 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Kiaa1549Q68FD9 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Kiaa1549Q68FD9 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Kiaa1549Q68FD9 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Kiaa1549Q68FD9 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Kiaa1549Q68FD9 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Kiaa1549Q68FD9 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Kiaa1549Q68FD9 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Kiaa1549Q68FD9 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms