Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PtprdQ64487 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PtprdQ64487 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PtprdQ64487 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PtprdQ64487 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PtprdQ64487 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PtprdQ64487 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PtprdQ64487 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PtprdQ64487 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PtprdQ64487 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
PtprdQ64487 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
PtprdQ64487 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PtprdQ64487 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PtprdQ64487 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PtprdQ64487 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PtprdQ64487 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PtprdQ64487 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PtprdQ64487 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PtprdQ64487 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PtprdQ64487 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PtprdQ64487 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtprdQ64487 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtprdQ64487 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtprdQ64487 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtprdQ64487 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtprdQ64487 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtprdQ64487 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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PtprdQ64487 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtprdQ64487 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtprdQ64487 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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PtprdQ64487 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtprdQ64487 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtprdQ64487 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtprdQ64487 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtprdQ64487 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtprdQ64487 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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PtprdQ64487 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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PtprdQ64487 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtprdQ64487 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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PtprdQ64487 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PtprdQ64487 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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PtprdQ64487 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PtprdQ64487 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PtprdQ64487 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PtprdQ64487 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PtprdQ64487 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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PtprdQ64487 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PtprdQ64487 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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PtprdQ64487 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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PtprdQ64487 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PtprdQ64487 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PtprdQ64487 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PtprdQ64487 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PtprdQ64487 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PtprdQ64487 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PtprdQ64487 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PtprdQ64487 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PtprdQ64487 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PtprdQ64487 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PtprdQ64487 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PtprdQ64487 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PtprdQ64487 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PtprdQ64487 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PtprdQ64487 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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