Protein–RNA interactions for Protein: Q62468

Vil1, Villin-1, mousemouse

Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vil1Q62468 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vil1Q62468 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vil1Q62468 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vil1Q62468 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vil1Q62468 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vil1Q62468 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vil1Q62468 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vil1Q62468 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vil1Q62468 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vil1Q62468 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vil1Q62468 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vil1Q62468 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vil1Q62468 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vil1Q62468 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vil1Q62468 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vil1Q62468 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Vil1Q62468 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Vil1Q62468 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Vil1Q62468 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vil1Q62468 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vil1Q62468 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vil1Q62468 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vil1Q62468 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vil1Q62468 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vil1Q62468 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vil1Q62468 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vil1Q62468 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vil1Q62468 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vil1Q62468 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vil1Q62468 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vil1Q62468 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vil1Q62468 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vil1Q62468 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vil1Q62468 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vil1Q62468 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vil1Q62468 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vil1Q62468 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vil1Q62468 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Vil1Q62468 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vil1Q62468 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vil1Q62468 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vil1Q62468 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Vil1Q62468 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vil1Q62468 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vil1Q62468 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vil1Q62468 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vil1Q62468 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vil1Q62468 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vil1Q62468 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vil1Q62468 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vil1Q62468 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vil1Q62468 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vil1Q62468 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vil1Q62468 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vil1Q62468 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vil1Q62468 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vil1Q62468 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Vil1Q62468 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vil1Q62468 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vil1Q62468 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vil1Q62468 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vil1Q62468 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vil1Q62468 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vil1Q62468 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vil1Q62468 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vil1Q62468 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vil1Q62468 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vil1Q62468 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Vil1Q62468 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vil1Q62468 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vil1Q62468 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vil1Q62468 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vil1Q62468 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vil1Q62468 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vil1Q62468 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Vil1Q62468 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vil1Q62468 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vil1Q62468 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vil1Q62468 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vil1Q62468 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vil1Q62468 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vil1Q62468 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vil1Q62468 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vil1Q62468 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Vil1Q62468 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vil1Q62468 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vil1Q62468 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vil1Q62468 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vil1Q62468 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vil1Q62468 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Vil1Q62468 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vil1Q62468 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vil1Q62468 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vil1Q62468 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vil1Q62468 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vil1Q62468 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vil1Q62468 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vil1Q62468 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vil1Q62468 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vil1Q62468 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms