Protein–RNA interactions for Protein: Q62074

Prkci, Protein kinase C iota type, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkciQ62074 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PrkciQ62074 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms