Protein–RNA interactions for Protein: Q61510

Trim25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim25Q61510 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim25Q61510 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim25Q61510 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim25Q61510 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim25Q61510 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim25Q61510 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim25Q61510 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim25Q61510 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim25Q61510 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim25Q61510 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim25Q61510 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim25Q61510 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim25Q61510 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim25Q61510 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim25Q61510 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim25Q61510 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim25Q61510 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim25Q61510 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim25Q61510 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim25Q61510 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim25Q61510 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim25Q61510 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim25Q61510 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim25Q61510 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim25Q61510 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim25Q61510 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim25Q61510 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim25Q61510 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim25Q61510 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim25Q61510 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim25Q61510 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim25Q61510 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim25Q61510 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim25Q61510 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim25Q61510 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim25Q61510 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim25Q61510 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim25Q61510 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim25Q61510 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim25Q61510 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim25Q61510 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim25Q61510 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim25Q61510 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim25Q61510 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim25Q61510 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim25Q61510 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim25Q61510 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim25Q61510 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim25Q61510 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim25Q61510 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim25Q61510 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim25Q61510 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim25Q61510 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim25Q61510 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim25Q61510 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim25Q61510 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim25Q61510 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim25Q61510 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim25Q61510 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim25Q61510 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim25Q61510 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim25Q61510 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim25Q61510 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim25Q61510 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim25Q61510 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim25Q61510 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim25Q61510 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim25Q61510 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim25Q61510 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim25Q61510 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim25Q61510 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim25Q61510 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim25Q61510 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim25Q61510 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim25Q61510 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim25Q61510 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim25Q61510 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim25Q61510 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim25Q61510 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim25Q61510 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim25Q61510 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim25Q61510 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim25Q61510 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim25Q61510 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim25Q61510 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim25Q61510 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim25Q61510 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim25Q61510 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim25Q61510 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim25Q61510 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim25Q61510 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim25Q61510 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim25Q61510 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim25Q61510 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim25Q61510 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim25Q61510 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim25Q61510 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim25Q61510 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim25Q61510 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim25Q61510 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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