Protein–RNA interactions for Protein: Q61508

Ecm1, Extracellular matrix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm1Q61508 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ecm1Q61508 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ecm1Q61508 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ecm1Q61508 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ecm1Q61508 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ecm1Q61508 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ecm1Q61508 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ecm1Q61508 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ecm1Q61508 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ecm1Q61508 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ecm1Q61508 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ecm1Q61508 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ecm1Q61508 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ecm1Q61508 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ecm1Q61508 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ecm1Q61508 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ecm1Q61508 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ecm1Q61508 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ecm1Q61508 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ecm1Q61508 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ecm1Q61508 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ecm1Q61508 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ecm1Q61508 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ecm1Q61508 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ecm1Q61508 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ecm1Q61508 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ecm1Q61508 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ecm1Q61508 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ecm1Q61508 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ecm1Q61508 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ecm1Q61508 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ecm1Q61508 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ecm1Q61508 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ecm1Q61508 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ecm1Q61508 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ecm1Q61508 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ecm1Q61508 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ecm1Q61508 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ecm1Q61508 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ecm1Q61508 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ecm1Q61508 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ecm1Q61508 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ecm1Q61508 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ecm1Q61508 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ecm1Q61508 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ecm1Q61508 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ecm1Q61508 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ecm1Q61508 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ecm1Q61508 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ecm1Q61508 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ecm1Q61508 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ecm1Q61508 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ecm1Q61508 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ecm1Q61508 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ecm1Q61508 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ecm1Q61508 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ecm1Q61508 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ecm1Q61508 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ecm1Q61508 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ecm1Q61508 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ecm1Q61508 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ecm1Q61508 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ecm1Q61508 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ecm1Q61508 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ecm1Q61508 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ecm1Q61508 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ecm1Q61508 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ecm1Q61508 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ecm1Q61508 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ecm1Q61508 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ecm1Q61508 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ecm1Q61508 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ecm1Q61508 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ecm1Q61508 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ecm1Q61508 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ecm1Q61508 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ecm1Q61508 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ecm1Q61508 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ecm1Q61508 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ecm1Q61508 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ecm1Q61508 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ecm1Q61508 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ecm1Q61508 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ecm1Q61508 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ecm1Q61508 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ecm1Q61508 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ecm1Q61508 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ecm1Q61508 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ecm1Q61508 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ecm1Q61508 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ecm1Q61508 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ecm1Q61508 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ecm1Q61508 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ecm1Q61508 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ecm1Q61508 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ecm1Q61508 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ecm1Q61508 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ecm1Q61508 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ecm1Q61508 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ecm1Q61508 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms