Protein–RNA interactions for Protein: Q61087

Lamb3, Laminin subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamb3Q61087 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms